孙悟空的身世之谜也被揭开，原来他是天地孕育的石猴，后来被菩提祖师收为徒弟，学会了七十二变，还学会了筋斗云，最厉害的是他还会长生不老之术，孙悟一出生就是仙石所化，所以他的寿命非常长，在西游记中，有一个神仙叫做太上老君，他是道教的创始人，也是三清之一，在西游记中，太太上老君曾经炼制过金丹，这个金丹可以延年益寿，孙悟空却不知道，他还以为是自己的母亲给他的呢。
《西游记》中第一章讲的就是猴王出世，对于美猴王孙悟空的身世早有交代，他是女娲补天时所遗留的补天石，集天地灵气孕育而生，也就是常说的是从石头缝里蹦出来的，天生地养，无父无母。不过很多人并不相信这样的说词，大家都有父母，凭什么就他没有，于是，很多人就试图给他找个父母。
有人说他是大禹的儿子，孕育他的石头叫望夫石，也就是大禹的老婆，当年因为等不到大禹，而化身成为石头，当时她已经怀有身孕，虽然变成石头，但腹中胎儿并未死去，经过不知道多少年，终于仙胎问世。最大的证据就是，大禹治水时用的金箍棒一见到孙悟空就显得如此亲昵，真正称心如意。
不过在生死簿上又是另一番描述，上面写明孙悟空乃是天产石猴，享年三百四十二岁。算是天地灵物，但并非五彩石，也不是望夫石，他是西游世界的位面之子，应劫而生，随缘而去。
其实除此之外还有一种说法，那就是他是当年的梅山七怪之首的袁洪所化。当年被杨戬引入山河社稷图，受困其中，千年以后脱困，化身孙悟空，他与杨戬之间就是一场惺惺相惜的宿命之战。他的法力当年就和杨建相当，这也很符合菩提老祖所说，他学习地煞七十二变是定数。为的就是了结前世的因果。这一战之后，他们终于成了可以称兄道弟的朋友。